Algunas investigaciones de filtración de agua se centra en las amenazas a la salud pública que plantea la contaminación del suministro de agua destinada al consumo humano, y otra investigación se centra en los problemas más grandes con los contaminantes del agua en los ecosistemas naturales. Diferentes técnicas para la filtración de agua eliminan posibles problemas, como colillas de cigarrillos, las toxinas de algas y parásitos. Colillas

En un estudio de la Universidad Estatal de San Diego encontró que una baja concentración de colillas de cigarrillos en el suministro de agua natural es mortal para los peces. El Grupo Asesor Colilla aboga por que el gobierno clasifica las colillas de cigarrillos como residuos peligrosos y desarrollar requisitos especiales para su eliminación trasero. Sistemas de filtración de agua municipales son eficaces en la eliminación de sólidos como colillas de cigarrillos durante el proceso de filtración antes de devolver el agua al medio natural.
Algas Toxinas

Microcystis es un alga que vive en los ríos y lagos y rezuma una toxina que daña el hígado de los humanos y los animales. Un estudio de la Universidad Estatal de Ohio encontró que el uso de los dos filtros de membrana y carbón activado puede eliminar las toxinas Microcystis del agua. Esta técnica ya se usaba como una técnica de filtración de agua para el filtrado de herbicidas y pesticidas fuera del agua para el consumo humano.
Giardia intestinalis

Wilkes University notas que Giardia lamblia, un parásito, ha sido un problema en el agua potable en los EE.UU. por lo menos quince años. De acuerdo con los Centros para el Control de Enfermedades (CDC), este parásito microscópico causa una enfermedad diarreica en los seres humanos llamada giardiasis. El CDC explica que las técnicas de filtración de agua en el hogar, tales como la ósmosis inversa puede eliminar este parásito a partir de agua potable doméstica obtenida de los pozos privados.