A diferencia de muchas especies terrestres, las formas de vida más acuáticos son muy sensibles a pequeños cambios en su hábitat. Requieren condiciones de vida precisos para prosperar. Factores abióticos, o factores "no vivos", pueden afectar la calidad de un ecosistema marino de muchas maneras. Incluso los pequeños ajustes a estos factores pueden determinar los organismos que viven en la región.

Organismos marinos de temperatura requieren temperaturas específicas en su entorno. La mayoría sólo pueden tolerar unos pocos grados de variabilidad en cada lado de esta temperatura. Contaminación del calor de las fábricas, generadores o el cambio climático global puede hacer que ciertos cuerpos de agua inhabitable para algunas especies sensibles. Por ejemplo, un aumento de la temperatura de los océanos de sólo uno o dos grados podría hacer que los arrecifes de coral de todo el mundo para blanquear y morir. A cambio de agua más fría puede tener efectos similares sobre las criaturas acuáticas.
Salinidad
ecosistemas marinos

se definen a menudo por la salinidad de sus aguas. Algunas especies sólo pueden sobrevivir en agua dulce, mientras que otros prefieren aguas "super-salinos" extremadamente salada o. Muchos organismos a favor de un equilibrio entre los dos, que ocupan las aguas salobres en arroyos o ríos se encuentran los océanos, golfos o mares. La mayoría de las especies de agua dulce no pueden tolerar el agua salada, y la mayoría de las especies de agua salada no pueden soportar agua dulce. Los organismos que viven en un ecosistema en particular sólo pueden soportar un rango de unas pocas partes por millón (ppm) en la salinidad.

Niveles de pH

Otro factor abiótico que tiende a afectar a los ecosistemas marinos exclusivamente es el nivel de pH de la masa de agua. El nivel de pH de una sustancia mide qué tan ácida o básica es. En los últimos años, los niveles de pH han estado cayendo en los lagos, ríos y océanos en todo el mundo debido a una creciente concentración de dióxido de carbono en la atmósfera. Esto corresponde a más ácido carbónico en las aguas de la tierra y la lluvia ácida de dióxido de azufre emitido por fábricas y la industria.
Sunlight

muchos cuerpos de agua, varios diferentes ecosistemas pueden existir uno sobre el otro, a diferentes profundidades. Porque la luz sólo puede penetrar tan profundamente en el agua, más profunda es el agua, menos luz que llega a los organismos que viven allí. Algunas especies de plantas acuáticas prefieren más luz, mientras que algunos pueden tolerar menos luz, al igual que las especies de plantas terrestres. Las plantas que sobreviven en cada nivel a su vez afectan a los demás organismos que viven allí.