elogiado como un tratamiento científico y basado en la evidencia para los niños con autismo y retrasos en el desarrollo, Análisis Aplicado de la Conducta, de acuerdo con la Autism Speaks sitio web, no está exenta de problemas o críticas, sin embargo. Existen varios factores que arrojan una sombra negativa sobre este método de tratamiento, por no hablar de su costo. Sin protocolo estandarizado

No hay directrices nacionales, estatales o regionales actualmente regulan Análisis Conductual Aplicado. Los estándares de elegibilidad sí existen para aquellos terapeutas que deciden someterse a autorización por la Junta de Certificación de analista del comportamiento, pero no es un requisito para practicar ABA. En este punto, las normas generalizadas sólo abordan los requerimientos grado, cursos y supervisión. Existen muchos programas para la terapia ABA, pero cada uno tiene sus diferencias. Esto hace que sea difícil de regular la administración del tratamiento ABA eficaz.
Horas amplias y costosas

terapia ABA requiere un mínimo de 20 horas y hasta 40 horas a la semana ser un tratamiento eficaz intervención para los niños con autismo y retraso en el desarrollo, según el sitio web de Autismo-Help. El tiempo extenso requerido para ver los resultados pueden ser desalentador muchos padres, ya que el nivel de la terapia generalmente no está disponible en muchas áreas. Terapia privado es caro y puede costar miles de dólares por año. El seguro de salud sólo podrá pagar una parte de estas horas, dependiendo del nivel de discapacidad de un niño.
Niño Diferente, trato diferente

Análisis Conductual Aplicado es no es un "one size fits all" tratamiento para el autismo o retrasos en el desarrollo. Todos los niños necesitan un programa personalizado depende de la importancia de su condición y necesidades. La falta de conocimiento sobre el diagnóstico, el autismo y el tipo de intervenciones necesarias, puede dejar la terapia ABA carece de algunos niños. Se necesita un ensayo y error para personalizar el programa para cada niño, que puede tomar mucho tiempo y esfuerzo por parte de los padres y terapeutas. La falta de un programa estandarizado puede dar lugar a retrasos en el tratamiento para un niño hasta que se descubrieron las intervenciones adecuadas.
La falta de profesionales de calidad y

La falta de directrices normalizadas también da lugar a una falta de profesionales de calidad que practican la terapia ABA. Un terapeuta puede practicar este tipo de terapia sin ningún entrenamiento formal, con sólo leer un libro o tomar un curso en línea rápida. La demanda de este tipo de terapia se ha incrementado con la cantidad de niños que son diagnosticados con algún tipo de trastorno del espectro autista. Muchos padres deciden implementar programas de ABA por su cuenta, debido a las extensas horas necesarias y la falta de terapeuta para implementar las horas.