La desinfección es un proceso de eliminación de casi todos los microorganismos patógenos, excepto las esporas bacterianas, en objetos y superficies inanimados. La desinfección no necesariamente mata todos los microorganismos, especialmente las esporas bacterianas resistentes; es menos exhaustiva que la esterilización, cuyo objetivo es destruir todo tipo de vida. Muchos métodos de desinfección son eficaces contra la mayoría de los patógenos reconocidos, pero fracasan contra algunos microorganismos como los priones.
Ejemplos de desinfección incluyen agua hirviendo, alcohol, luces ultravioleta y agentes químicos como lejía. A diferencia de la eliminación completa de microorganismos que se logra con los procesos de esterilización, la desinfección generalmente es ineficaz contra las esporas bacterianas.