El biodiesel es considerado como una fuente alternativa de combustible que será favorable para el medio ambiente. Mientras que el biodiesel no libera gases de efecto invernadero en la atmósfera y es una fuente de energía renovable , hay algunas desventajas cuando se trata de el proceso de fabricación de biodiesel. Mayor Costo de Producción

El costo de producción de biodiesel es mucho mayor que el diesel de petróleo . Según cpast.org , el biodiesel es de aproximadamente 150 por ciento más caro de producir . Los altos costos de producción son el resultado de la cantidad de soja utilizada en la producción de biodiesel. Un grano de soja contiene aceite sólo el veinte por ciento , se requieren por lo tanto una gran cantidad de semillas de soja para producir una cantidad muy pequeña de biodiesel.
Energía

Al tratar de hacer una más económico y fuente de combustible renovable , estamos usando mucho más energía en la producción de combustible biodiesel. El proceso de fabricación consume cantidades enormes de energía para producir biodiesel a partir de las semillas de soja. Además, se necesitan recursos adicionales para el cultivo y la cosecha de la soja .
Producción calidad consistente

El biodiesel es un proceso muy difícil porque hay muchos detalles y casi no hay espacio para el error. Un pequeño error en el proceso puede conducir a un biodiesel completamente diferente. Biodiésels tienen diferentes mezclas para adaptarse mejor a los diferentes vehículos e incluso temperaturas diferentes .

Desde una pequeña fluctuación en la composición se puede hacer una gran diferencia en la calidad , es difícil proporcionar la misma , una calidad consistente en todo momento. Según Greenfuels.org los productores de biodiésel están tratando de resolver este problema mediante el cumplimiento de la ASTM ( Sociedad Americana para Pruebas y Materiales ) directrices y normas para el biodiesel.
Tierra Agrícola

La gran demanda de los cultivos de soja en biodiesel de fabricación puede conducir a un aumento en los precios de las verduras . Para evitar biodiesel a partir de aumentar el costo de los cultivos , habrá dos campos muy diferentes para la producción de semillas de soja . Si la necesidad de biodiesel aumenta, los agricultores no tienen suficiente tierra agrícola de ampliar y crecer que muchos cultivos.

Los mismos agricultores no serían capaces de producir cultivos para consumo público para la alimentación y la industria esto inevitablemente conducir a una escasez de cultivos alimentarios y la inflación.