Giardia lamblia se clasifica como un protozoo, que es un grupo diverso de organismos microscópicos y eucariotas que incluyen no solo protozoos sino también algas unicelulares y mohos limosos. Los protozoos se distinguen de las bacterias y los hongos por su estructura celular más compleja y, por lo general, mayor movilidad. Específicamente, Giardia lamblia es un protozoo flagelado, lo que significa que posee una o más estructuras en forma de látigo llamadas flagelos para el movimiento.