La principal función digestiva que se produce en el estómago es la digestión de proteínas. El estómago es un órgano muscular que secreta jugo gástrico, que contiene ácido clorhídrico y la enzima pepsina. El ácido clorhídrico crea un ambiente ácido en el estómago, que mata las bacterias y desnaturaliza las proteínas, haciéndolas más susceptibles a la digestión por la pepsina. La pepsina es una proteasa que descompone las proteínas en péptidos más pequeños, iniciando el proceso de digestión de las proteínas.