De hecho, el Gran Incendio de Londres tuvo un impacto negativo en la plaga. El incendio destruyó muchos de los edificios infectados y mató a muchas de las personas infectadas, pero también creó las condiciones ideales para que la plaga se propagara. Los supervivientes del incendio sin hogar se vieron obligados a vivir en condiciones de hacinamiento y condiciones insalubres, lo que los hizo más susceptibles a la enfermedad. Además, el incendio afectó a la infraestructura de la ciudad, dificultando la distribución de alimentos y agua y el control de la propagación de la enfermedad. Como resultado, la peste continuó propagándose en Londres durante varios meses después del incendio.