El origen principal del sistema respiratorio es el endodermo, concretamente del intestino anterior ventral. El intestino anterior es la parte más anterior del intestino primitivo y se desarrolla en los sistemas respiratorio y digestivo. El sistema respiratorio surge del intestino anterior ventral, que da origen a la tráquea, los bronquios y los pulmones. Durante el desarrollo embrionario, las células endodérmicas del intestino anterior se espesan y forman un divertículo respiratorio, que se evagina y se desarrolla en el sistema respiratorio.