No todos los antígenos son inmunógenos. Un inmunógeno es un antígeno que es capaz de estimular una respuesta inmune, mientras que un antígeno es cualquier sustancia reconocida por el sistema inmunológico. Algunos antígenos no son inmunogénicos, ya sea porque no pueden ser procesados por el sistema inmunológico o porque no contienen las estructuras moleculares necesarias para desencadenar una respuesta inmune. Por ejemplo, algunos polisacáridos son antígenos pero no inmunogénicos, mientras que algunas proteínas son tanto antígenos como inmunógenos.