La digestión de proteínas termina en el intestino delgado. Las proteínas son parcialmente digeridas en el estómago por la enzima pepsina y luego descompuestas en aminoácidos por varias enzimas, como tripsina, quimotripsina y elastasa, dentro del intestino delgado. Estos aminoácidos luego son absorbidos por las células que recubren el intestino delgado.